1967年上海的“一月风暴”，导致了全国范围内的全面夺权。到1969年中共九大召开前，全国党的各级组织全部处于瘫痪状态，从中央委员会、中央政治局到各省、市、自治区党委，以至基层党的组织，都还不能正常工作或者根本没有恢复起来。绝大多数党员也还没有恢复党的组织生活。相当多的中共八届中央委员会委员仍处在被审查、被监禁的状况。尽管按照中共八大党章已经大大超过五年召开一次全国代表大会的规定，但从当时党内、国内各方面条件来看，召开一次全国代表大会的条件是极其不成熟的。但是，1968年10月召开的中共八届十二中全会认为，以刘少奇为代表的“资产阶级司令部”及其在各地的“代理人”已被打倒，夺权的任务已经完成，“文化大革命”取得了决定性的胜利，因而召开党的九大便成为巩固已取得的成果的一项迫切任务。党的八届十二中全会为九大作了直接的准备。全会通过了新党章草案和九大代表产生的办法。此后各地为九大的召开作了具体的准备。

在产生中共九大代表的工作中，由于党的组织处于瘫痪状态，根本无法进行正常的选举，大都是由革命委员会同各造反派组织的头头协商决定或上级指定的，这种违背党章的做法，使代表的产生出现了许多严重的问题。很多品质恶劣的帮派骨干，林彪、江青一伙的爪牙，成了九大代表。有的人是在确定为九大代表之后，才赶办入党手续，或在火车上突击入党的。而大批优秀的共产党员或党的老一辈无产阶级革命家，却被排挤在九大之外，被剥夺了参加九大的权利。

1969年3月9日至27日，中央文革碰头会召集各省、市、自治区革命委员会、各大军区和中央各部门的负责人开会，对九大进行具体的筹备。这时，苏联军队两次入侵我珍宝岛地区，发生了中苏边界武装冲突——珍宝岛事件。这件事更加助长了对国际形势严峻性的估计，给九大以重要影响。

毛泽东在预备会上提出九大的任务是：总结经验，落实政策，准备打仗。这三句话后来就成了九大的指导思想。

1969年4月1日至24日，中国共产党第九次代表大会在北京举行。出席大会的代表共1512人，代表党员约2200万人。

4月1日下午毛泽东主持了开幕式，并致开幕词。他回顾了党的历次代表大会的情况，希望“大会开成一个团结的大会，胜利的大会。大会以后，在全国取得更大胜利”。

大会的主要议程有三项：一、林彪代表中国共产党中央委员会作政治报告;二、修改中国共产党党章;三、选举党的中央委员会。

由林彪宣读的政治报告共分八个部分：(一)关于无产阶级文化大革命的准备;(二)关于无产阶级文化大革命的过程;(三)认真搞好斗、批、改;(四)关于无产阶级文化大革命的政策;(五)关于我国革命的最后胜利;(六)关于党的整顿和建设;(七)关于我国的国际关系;(八)全党、全国人民团结起来，争取更大的胜利。这个报告是以“无产阶级专政下继续革命的理论”为核心的。它的主要错误是：1、极力宣扬“文化大革命”的必要性及“丰功伟绩”。报告强调“我国的无产阶级文化大革命，是一场大规模的，真正的无产阶级革命”，“是对马克思列宁主义理论和实践的一个伟大的新贡献”。报告对于毛泽东发动“文化大革命”的主要理论作了阐述和肯定，又将毛泽东晚年在关于社会主义社会阶级斗争问题上的“左”倾错误观点系统起来，归纳成为指导“文化大革命”的所谓“无产阶级专政下继续革命的理论”，并把它说成是我国社会主义革命和社会主义建设的“灯塔”，是对“马克思列宁主义理论和实践的一个伟大的新贡献”。从而使指导“文化大革命”的错误理论进一步合法化。2、报告把党的全部历史说成是两条路线斗争的历史，虚构了一个根本不存在的以刘少奇为头子的“资产阶级司令部”，把“叛徒、内奸、工贼”的帽子强加在刘少奇头上。3、报告对当时国内阶级斗争形势作了完全错误的估计，把整个社会主义历史阶段始终存在着阶段斗争的错误理论作为党的“基本路线”加以宣扬。说刘少奇一伙是一个“反革命修正主义集团”，要在中国“复辟资本主义”。报告规定今后“文化大革命”的任务是“认真搞好斗、批、改”，即建立三结合的革命委员会、大批判、清理阶级队伍、整党、精简机构、改革不合理的规章制度、下放科室人员等。4、报告在对国际形势的估计上，夸大了帝国主义发动世界大战的可能性，因而过分地强调了要准备打仗。

中共九大通过的新党章对毛泽东思想作了歪曲和夸大其作用的阐述。总纲中说，“毛泽东思想是在帝国主义走向全面崩溃、社会主义走向全世界胜利的时代的马克思列宁主义”，“把马克思列宁主义提高到一个崭新阶段”。九大通过的党章违背党的组织原则，说林彪“一贯高举毛泽东思想伟大红旗，最忠诚、最坚定地执行和捍卫毛泽东同志的无产阶级革命路线”，“是毛泽东同志的亲密战友和接班人”。九大通过的党章还对八大党章的正确内容，作了错误的修改，将党员权利一节全部砍掉，使广大党员在党内只有“必须”执行的义务，而没有任何权利。新党章还取消了党员的预备期，取消了中央书记处，取消了中央监察委员会等机构，这些规定对党的建设造成了恶劣的影响。

大会选出170名中央委员和109名候补中央委员，其中原八届中央委员和候补中央委员只有53人。毛泽东当选为中央委员会主席，林彪当选为副主席。毛泽东、林彪、周恩来、陈伯达、康生当选为中央政治局常委。当选为中央政治局委员的，除上述5名中央政治局常委外，还有叶群、叶剑英、刘伯承、江青、朱德、许世反、陈锡联、李先念、李作鹏、吴法宪、张春桥、姚文元、黄永胜、董必武、谢富治。当选为中央政治局候补委员的有纪登奎、李雪锋、李德生、汪东兴。

从这个名单可以看出，林彪、江青集团的主要成员，几乎全部都进入了中央政治局，从而加强了他们在党中央的势力。

中国共产党第九次全国代表大会在政治上、思想上和组织上的指导方针都是错误的。它是在经过将近三年的“文化大革命”的大动乱时期召开的，这时已打倒了所谓以刘少奇为首的“资产阶级司令部”，全国除台湾省外的29个省、市、自治区的党委，人民委员会都被夺了权，全部建立了“革命委员会”。中共九大的召开，使这些所谓“伟大的胜利”得到了肯定和承认，使“文化大革命”的错误理论和实践更加完备和合法化。